Approaching the epigenome of triple negative breast cancer to identify new biomarkers

  1. Mendaza Lainez, Saioa
Supervised by:
  1. David Guerrero Setas Director
  2. Esperanza Martin Sanchez Director

Defence university: Universidad Pública de Navarra

Fecha de defensa: 30 June 2020

Committee:
  1. Agustin Fernández Fernández Chair
  2. Luis José Lombardía Ferreira Secretary
  3. María José Merino Neumann Committee member

Type: Thesis

Teseo: 633975 DIALNET lock_openAcademica-e editor

Abstract

El cáncer de mama (CM) es la neoplasia más frecuente en todo el mundo y la primera causa de muerte por cáncer en mujeres. El cáncer de mama triple negativo (CMTN) representa el 10-20% de todos los CM diagnosticados y es el subgrupo más agresivo puesto que carece tratamiento dirigido. Por lo tanto, el descubrimiento de nuevos biomarcadores y dianas terapéuticas es necesario. Dado que las alteraciones epigenéticas están involucradas en la tumorigénesis, la caracterización de la metilación del DNA y la acetilación de histonas puede ser útil para la identificación de nuevas firmas potencialmente diagnósticas o pronósticas, así como alteraciones destinatarias de fármacos dirigidos. En la presente tesis, se caracterizó la metilación de DNA del genoma completo de 8 CMTN y seis tejidos mamarios no neoplásicos mediante Illumina Human Methylation 450K BeadChip. Estos datos se analizaron desde dos enfoques bioinformáticos diferentes. Concluimos que el patrón epigenético (metiloma de DNA y acetiloma de histonas) está alterado en CMTN respecto a tejido mamario no neoplásico. Así como que la hipometilación de ADAM12 y la acetilación de H4K5 son potenciales biomarcadores de peor pronóstico y que ADAM12 es una potencial diana terapéutica en CMTN. También sugerimos la utilidad diagnóstica de una nueva firma basada en metilación de DNA y las diferencias entre los genes regulados por la acetilación de H4K6ac según la naturaleza de las líneas (no neoplásicas o TNBC).