Analisis y caracterizacion de las regiones 5' no codificante, e1, e2/ns1 y ns5 del genoma del virus c de la hepatitis en pacientes españoles y sus relaciones filogeneticas con cepas de otros origenes

Resumen

El virus c de la hepatitis es el principal agente etiologico de las hepatitis no a, no b de origen postransfuional y esporadico. Se ha se ha clonado y secuenciado en 24 pacientes españoles parte de la region 5' no codificante del genoma del virus, y, en cuatro de ellos, ademas las regiones. E1, e2/ns1 y parte de la region ns5 del mismo. Se ha analizado la variabilidad de estas regiones en todos los aislados presentes en la base de datos genbank y en los obtenidos en este estudio determinando las zonas de mayor y menor conservacion entre todas ellas. En la region 5' no codificante se ha descrito la presenciadel motivo gcggaa conservado en todo los aislados caracterizados hasta la fecha y presente tambien el virus herpes tipo 1 como secuencia importante en la regulacion y expresion de este. Por otro lado se ha analizado la relacion filogenetica entre los aislados secuenciados en este estudio y los previamente descritos en otras partes del mundo. 23 de los 24 aislados caracterizados en la region 5' no codificante corresponderian al tipo 1 mientras que un aislado corresponderia al tipo 3. En los cuatro pacientes en los que se estudiaron las otras regiones subgenomicas se encontraron, en tres de ellos, secuencias correspondientes al subtipo 1b, mientras que en elcuartose encontraron secuencias correspondientes a los subtipos 1a y 1b, indicando una infeccion mixta. Varias de estas secuencia corresponden a una variante española distinta a la previamente descrita.